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Proyectos de investigación

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Integración de estrategias genómicas y epigenómicas para el análisis de neoplasias linfoblásticas T en el contexto de una medicina individualizada de precisión

XIX Concurso Nacional para la adjudicación de Ayudas a la Investigación en Ciencias de la Vida y de la Materia (Convocatoria 2018)

Medicina de precisión y cáncer

Investigador Principal: José Fernández Piqueras

Centro de investigación o Institución: Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa". CSIC-Universidad Autónoma de Madrid

Sinopsis

Las neoplasias linfoblásticas de células T precursoras constituyen un grupo muy agresivo de tumores que se originan a partir de timocitos inmaduros. A pesar de los éxitos conseguidos por la quimioterapia, la aparición de resistencias y recidivas hacen que la curación no supere el 7% en estos casos. Por tanto, existe la necesidad urgente de identificar nuevos biomarcadores que permitan el desarrollo de tratamientos más efectivos y menos tóxicos. Nuestro trabajo se ha centrado en la integración de datos ómicos (Whole-exome, RNA-Seq) para buscar nuevas alteraciones genéticas de utilidad clínica. 

En el último año hemos continuado con la identificación  de nuevas mutaciones y cambios significativos en la expresión de genes críticos que nos ha permitido proponer nuevas estrategias de terapia dirigida usando el algoritmo PanDrugs, en el contexto de una medicina personalizada de precisión; hemos confirmado el potencial de los análisis transcriptómicos para identificar nuevos transcritos de fusión que funcionan como nuevos biomarcadores de malignidad en nuestros tumores; hemos evidenciado que la eficacia de los inhibidores de la γ‐secretasa dependen de la dosis génica del gen MYC (The Oncologist); y hemos realizado un análisis proteómico (usando DIA) que revela nuevas funciones no-apoptóticas de FADD en neoplasias linfoblásticas (enviado). Con el fin de comprender mejor la eficacia de los tratamientos con radiación hemos demostrado las ventajas de los regímenes de radiación combinados en el control de la tumorigénesis que permiten controlar mejor la homeostasis del tejido sano y facilitar la muerte de las células tumorales (Scientific Reports). Por último, hemos presentado un nuevo método para detectar y cuantificar los ARN no codificantes largos (lncRNAs) de las regiones teloméricas (TERRA y TERC) en líneas celulares y en la sangre, con amplias aplicaciones en la investigación básica y el diagnóstico clínico (Nature Communications Biology).

 

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