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Proyectos de investigación

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Estudio global del interactoma proteico virus-huésped mediante el empleo de doble híbrido acoplado a análisis mediante secuenciación masiva

XIX Concurso Nacional para la adjudicación de Ayudas a la Investigación en Ciencias de la Vida y de la Materia (Convocatoria 2018)

Diálogo intercelular e interactoma: implicaciones patológicas

Investigador Principal: Margarita Salas Falgueras

Centro de investigación o Institución: Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa". CSIC-Universidad Autónoma de Madrid

Sinopsis

El resultado de la replicación de un virus dentro de la célula huésped depende de un gran número de interacciones moleculares. El objetivo de este proyecto es aprovechar el reciente desarrollo de tecnologías de alta capacidad para estudiar las interacciones virus-hospedador a nivel molecular. Durante este año, realizamos un análisis exhaustivo de las interacciones proteína-proteína (PPI) entre el virus Bam35, paradigma de los betatectivirus, y su hospedador natural Bacillus thuringiensis HER1410. Para ello hemos desarrollado una metodología que acopla la detección de interacciones mediante el doble híbrido levadura (Y2H) con secuenciación de alto rendimiento (HTS). El análisis inicial de los datos crudos permitió la identificación de más de 4.000 interacciones candidatas, a las que se aplicaron sucesivos filtros basados en criterios técnicos y biológicos para producir 182 interacciones de alta confianza que se definieron como el interactoma virus-hospedador. En general, las proteínas y peptidasas del metabolismo del huésped son las más frecuentes dentro de las interacciones detectadas, lo que distingue este sistema de otras PPI de fago-hospedador notificados. Nuestro enfoque también nos permitió sugerir nuevos papeles biológicos para varias proteínas Bam35 de función desconocida, incluida la proteína estructural de membrana P25, que puede ser un centro viral con un papel en la modificación de la membrana del huésped durante la morfogénesis de partículas virales. Estos resultados permitieron una mejor comprensión del sistema Bam35-B. thuringiensis a nivel molecular, mostrando el gran potencial del enfoque Y2H-HTS para otros modelos de virus-huésped.

Para caracterizar aún más las interacciones betatectivirus-huésped, recientemente comenzamos el estudio de la modificación transcripcional en Bt ante la presencia del (pro)fago, tanto en el ciclo lisogénico como en el lítico. Se analizarán dos betatectivirus diferentes (GIL01 y GIL16) tras la infección de la cepa GBJ002 de Bacillus thuringiensis, el huésped natural de GIL01, y tras la inducción del ciclo lítico por respuesta SOS. 

Nota: el profesor Modesto Redrejo Rodríguez es el investigador principal de este proyecto, desde el fallecimiento de doña Margarita Salas Falgueras, en noviembre de 2019.

 

Producción Científica
 
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